Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gapvd1Q6PAR5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gapvd1Q6PAR5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms