Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd3Q6P9Z1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd3Q6P9Z1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms