Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frg2f1Q6P3A2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms