Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Soga3Q6NZL0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Soga3Q6NZL0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms