Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad17Q6NXW6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad17Q6NXW6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms