Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc3bQ6NWW9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc3bQ6NWW9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms