Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Colgalt2Q6NVG7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colgalt2Q6NVG7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms