Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HelbQ6NVF4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HelbQ6NVF4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms