Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc66Q6NS45 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms