Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggnbp1Q6K1E7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms