Protein–RNA interactions for Protein: Q6IS41

Slc25a47, Solute carrier family 25 member 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a47Q6IS41 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc25a47Q6IS41 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms