Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt87Q6IMF0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt87Q6IMF0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt87Q6IMF0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt87Q6IMF0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt87Q6IMF0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt87Q6IMF0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt87Q6IMF0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms