Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arhgap20Q6IFT4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms