Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil1Q6EDY6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms