Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scaf8Q6DID3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms