Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmcc1Q69ZZ6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms