Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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