Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ric1Q69ZJ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms