Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msl2Q69ZF8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msl2Q69ZF8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms