Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk13Q69ZA1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Cdk13Q69ZA1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk13Q69ZA1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms