Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn2Q68FG2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms