Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3ipQ68EF0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms