Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno1Q689Z5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms