Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem1Q684R7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Frem1Q684R7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem1Q684R7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem1Q684R7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem1Q684R7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem1Q684R7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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