Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp9bQ66X22 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp9bQ66X22 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms