Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CilpQ66K08 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms