Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Top2bQ64511 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top2bQ64511 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms