Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja3Q64448 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja3Q64448 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja3Q64448 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja3Q64448 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja3Q64448 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gja3Q64448 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja3Q64448 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja3Q64448 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms