Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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