Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Aebp1Q640N1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aebp1Q640N1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Aebp1Q640N1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms