Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc18Q640L5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms