Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms