Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms