Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CcncQ62447 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms