Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tff3Q62395 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms