Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spock1Q62288 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spock1Q62288 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms