Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sall3Q62255 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms