Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox19Q62249 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox19Q62249 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms