Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5dQ62240 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5dQ62240 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms