Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf1Q61999 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Odf1Q61999 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms