Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pcbp2Q61990 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pcbp2Q61990 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms