Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Npm1Q61937 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm1Q61937 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm1Q61937 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm1Q61937 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm1Q61937 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms