Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt33bQ61897 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms