Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga6Q61739 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms