Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HlxQ61670 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HlxQ61670 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms