Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd55bQ61476 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd55bQ61476 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms