Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms