Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tfap2bQ61313 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms