Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3Q60803 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms