Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csnk2a1Q60737 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk2a1Q60737 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms